تحتم متطلبات التنمية على الأكاديميين والباحثين على اختلاف تخصصاتهم المبادرة بإجراء أبحاث أصيلة ومبتكرة في شتى حقول المعرفة، وذلك انطلاقاً من أن البحث العلمي يعد من الوظائف الرئيسية التي تنهض بها الجامعة، كما أن تقدم أي جامعة بما تنجزه من أبحاث ذات صبغة تنموية و مردود جيد.
وإدراكاً من إدارة الجامعة لأهمية البحث العلمي ودوره في تجسيد رسالة الجامعة وتأكيد دورها في خدمة المجتمع، فقد بادرت إلى تأسيس عمادة البحث العلمي وأولتها جل اهتمامها وإمكاناتها بهدف تطويرها والارتقاء بها.
أُنشئت كلية الدراسات العليا أواخر عام 2015 بنظام وتعليمات خاصة بها ترتكز على الدراسة بالانتظام تجسيداً لرسالة الجامعة في الريادة والتميز والإبداع في مجالات التعليم الجامعيّ وترسيخ مكانتها القيادية في التعليم العالي الفلسطيني.
وقد تم اعتماد مجموعة من برامج الماجستير في مجالات مخلتفة ومتنوعة. ويجري العمل على فتح تخصصات جديدة وفق المعايير المعتمدة من هيئة الاعتماد والجودة والنوعية تشمل درجتي الدكتوراه والماجستير، وذلك استمراراً لرؤية الجامعة ورسالتها بإعداد خريجين مؤهلين لتلبية حاجات المجتمع، قادرين على المنافسة في سوق العمل المحلي والإقليمي، والإسهام الفاعل والمتميز في مجال البحث العلميّ، وبناء القدرات التقنية والبشرية.
وتسعى الكلية إلى بناء شراكات في برامج الدراسات العليا مع الجامعات الفلسطينية والعربية وتوثيق روابط التعاون الأكاديمي والبحثي، فلسطينياً وإقليمياً وعالمياً، في المجالات التي تخدم المجتمع الفلسطيني.
كما سعت الكلية لمواكبة التطورات العلمية العالمية في شتى المجالات العلمية في ظل القفزات النوعية الواسعة في تقنيات الاتصال، فوفرت البنية التحتية لطلبتها من مختبرات حديثة مجهزة، ومكتبات ورقية وإلكترونية مرتبطة بقواعد البيانات العالمية، إضافة إلى تقنيات اللوح الذكي و"الفيديو كونفرنس" والصف الافتراضي.
وقد استطاعت الكلية أن تحافظ على استمرارية العملية التعليمية في ظل جائحة كورنا التي نتج عنها إغلاق الجامعات باستخدام تقنيات التعليم الإلكتروني ونظم الاتصالات المختلفة، حيث استطاعت لأول مرة أن تجمع طلبة غزة والضفة في بيئة تعليمية واحدة من خلال تقنية الصف الافتراضي، كما شهدت الكلية أول مناقشة لرسالة ماجستير عبر الإنترنت في فلسطين خلال فترة إغلاق الجامعات.
وقد حقق خريجو كلية الدراسات العليا إنجازات أكاديمية مرموقة في مجالي البحث والتدريس؛ فقد فاز اثنان منهم عن رسائلهم الماجستير في المرتبة الأولى والثانية في مسابقة "الطالب الجامعي الباحث" التي نظمتها وزارة التعليم العالي والبحث العلمي على مستوى فلسطين، وشارك عدد من طلبة برنامج ماجستير اللغة العربية وآدابها في تأليف منهاج اللغة العربية الذي تشرف على تأليفه وزارة التربية والتعليم.