بدأ فرع قلقيلية تقديم خدماته كمركز عام 1998، ومن ثم تحول لفرع نتيجة الزيادة الواضحة في أعداد الطلبة في 2004/9/1. ويعد فرع جامعة القدس المفتوحة الوحيد في المحافظة الذي يلبي حاجتها من الخدمات التعليمية، مع بداية الفصل الدراسي من العام (2017/2016) تم افتتاح الحرم الجامعي الجديد، ويحظى الفرع باهتمام كبير من مؤسسات المجتمع المحلي، كما أن هناك تفاعلاً متبادلاً مع مؤسسات المجتمع المحلي من خلال برنامج تدريب الطلبة ودمجهم في العديد من المؤسسات المحلية، وخلال الدورات التي يقدمها الفرع، وينظمها مركز التعليم المستمر.